氣相色譜儀要遵守“先通氣、后開電，先關(guān)電、后關(guān)氣”的基本操作原則。
1、氣相色譜儀氣路中穩(wěn)壓閥，一般在出廠前都調(diào)整好用戶不必再變動，若需重新調(diào)整則必須注意穩(wěn)壓閥只有在閥前后壓差大于0.05MPa的條件下才能穩(wěn)壓作用，氣相色譜儀上的穩(wěn)壓閥入口壓力不得超過0.6MPa，超過了要損壞穩(wěn)壓閥；
2、柱箱溫度的設(shè)置必須低于色譜固定液的使用溫度，檢測器溫度的設(shè)置應(yīng)保證樣品在檢測器中不冷凝，汽化室進樣器系統(tǒng)的溫度設(shè)置應(yīng)高于樣品組份的平均沸點，一般應(yīng)高于柱箱溫度30～50℃；
3、熱導(dǎo)檢測器的操作必須嚴(yán)格遵守?zé)釋?dǎo)檢測器先通載氣后通熱導(dǎo)恒流源的操作原則。在長期停機后重新啟動操作時，應(yīng)先通載氣15分鐘以上，然后檢測器通電，以保證熱導(dǎo)元件不被氧化或燒壞；
4、更換汽化室硅橡膠墊時，務(wù)必先把熱導(dǎo)池橋電流關(guān)掉，換好硅橡膠墊后，通載氣幾分鐘后再接通橋電流；
5、在國內(nèi)熱導(dǎo)檢測器被廣泛采用的載氣是用氫氣，載氣通入氣相色譜儀前應(yīng)先通過氣體凈化管，氣體凈化管內(nèi)裝有分子篩，用來吸除載氣中水份，內(nèi)裝105催化劑，用來吸除載氣中氧，除去水份和氧是為了保護色譜柱和檢測器，延長使用壽命。所以，氣體凈化管內(nèi)的吸附劑必須定期活化處理，以保持凈化效果；
6、氣相色譜儀使用后關(guān)機時，在高溫使用后，尤其要注意必須在柱箱和檢測器溫度降到70℃以下，才能關(guān)閉氣源；
7、色譜柱連接用密封圈可根據(jù)不同使用溫度采用不同材料，一般在200℃以下可采用硅橡膠圈，200℃～250℃以下可采用聚四氟乙烯圈，250℃以上可采用紫銅圈或柔性石墨圈；
8、氣相色譜儀關(guān)機時，先降柱溫然后關(guān)斷載氣氣源。
