由于石墨特有的耐高溫性能，在氣相色譜儀中，石墨墊主要是在進(jìn)樣口和檢測(cè)器噴嘴部分，石墨墊的主要故障是漏氣和雜質(zhì)。由于石墨減少導(dǎo)致的漏氣是重現(xiàn)性差的原因。
石墨中的雜質(zhì)可能有兩個(gè)方面的影響：第一，于玻璃襯管或者色譜柱入口側(cè)的連接部分原因，一般會(huì)出現(xiàn)鬼峰，在分流分析時(shí)，柱入口側(cè)的石墨壓環(huán)的影響較小;第二，由于柱出口側(cè)的連接部或者FID的噴嘴原因，一般出現(xiàn)基線(xiàn)漂移。
日常分析中，安裝更換新的石墨墊升溫分析中檢測(cè)出鬼峰時(shí)、基線(xiàn)漂移增大時(shí)，需要進(jìn)行石墨墊的維護(hù)。與石墨墊的維修同樣道理，最好在使用之前維護(hù)，長(zhǎng)時(shí)間放置之后可能會(huì)重新吸附雜質(zhì)。
石墨墊的維護(hù)一般用以下兩種方法：
使用氣體噴燈的方法:將石墨墊放入噴燈的藍(lán)色火焰中，燒成赤熱1s～2s。
使用柱溫箱的方法:將石墨墊放入氣相色譜儀柱溫箱中，用400℃溫度處理2～3h。
